W związku ze spadkiem liczebności wielu gatunków dzikiej fauny i flory i groźbą ich wyginięcia, w latach 70-tych ubiegłego wieku Rada Europy rozpoczęła negocjacje, które zakończyły się podpisaniem 19 września 1979 r. w Bernie międzynarodowej umowy - Konwencji o ochronie gatunków dzikiej flory i fauny europejskiej oraz ich siedlisk. Państwa, będące stronami Konwencji są zobowiązane do realizowania działań mających na celu ochronę zagrożonych i ginących gatunków i ich siedlisk, prowadzenia działań edukacyjnych i rozpowszechniania informacji dotyczących ochrony dzikiej fauny i flory oraz podjęcia międzynarodowej współpracy mającej na celu ochronę gatunków transgranicznych. Polska przystąpiła do konwencji w 1999 r.

Podjęcie i koordynację działań na rzecz spójnej ochrony przyrody w Europie ułatwił proces integracji europejskiej, dzięki której dziką faunę, florę i naturalne siedliska chroni najmłodsza w Polsce prawna forma ochrony przyrody, jaką stanowią obszary Natura 2000. 

Regionalny Dyrektor Ochrony Środowiska w Bydgoszczy koordynuje funkcjonowanie obszarów Natura 2000 na obszarze województwa kujawsko-pomorskiego, a także jest organem sprawującym nadzór nad tymi obszarami.

W województwie kujawsko-pomorskim w skład sieci Natura 2000 wchodzą 44 obszary, zajmujące łącznie 11% powierzchni województwa. Na terenie województwa znajduje się zarówno jeden z najmniejszych obszarów Natura 2000 w Polsce (Kościół w Śliwicach PLH040034 o pow. 0,1 ha) oraz największy (Bory Tucholskie PLB220009 o pow. 322 535,9 ha). Wśród obszarów objętych tą formą ochrony przyrody warto wspomnieć o rzekach Brda i Wda, które są jednymi z najpiękniejszych szlaków kajakowych w Polsce oraz o Dolinie Noteci, która w plebiscycie 7 Nowych Cudów Polski zdobyła I miejsce i okrzyknięta została największym cudem Natury 2013.

Więcej informacji o Sieci Natura 2000 odnaleźć można w serwisie internetowym Regionalnej Dyrekcji Ochrony Środowiska w Bydgoszczy w części NATURA 2000.